Les quatre communautés de communes Jura Sud, Pays des Lacs, Petite Montagne et Région d’Orgelet ont fusionné le 1er janvier 2020.
La nouvelle collectivité dispose de quatre bourgs-centres où sont maintenus et développés les services de proximité pour tous : Arinthod, Clairvaux-les-Lacs, Moirans-en-Montagne et Orgelet, ce dernier étant le siège social de la nouvelle intercommunalité.
L’installation du nouvel exécutif pour Terre d’Émeraude Communauté s’est déroulé lors du Conseil communautaire du 16 juillet 2020 à Orgelet.
Le nouveau conseil communautaire composé de 116 délégués communautaires a élu 15 Vices-président(e)s et 13 membres du bureau. Le Président Philippe PROST a nommé en sus 5 délégations et missions spéciales.